选择代工厂加工燕窝有一些优势和劣势，具体情况需要根据自己的情况来综合考虑。

优势：

1. 节省成本：与自己独立生产相比，选择代工厂加工可以节省生产成本，因为代工厂可以利用自己的资源和优势来降低成本。

2. 提高生产效率：代工厂通常具有更高的生产效率和更先进的生产设备，可以加快生产速度，提高生产效率。

3. 提高产品质量：代工厂通常有专业的技术团队和严格的品质管理体系，可以提高产品质量。

4. 降低生产风险：选择代工厂加工可以降低生产风险，因为代工厂有丰富的经验和专业的技术团队，可以有效地避免生产过程中的问题。

劣势：

1. 无法掌控生产过程：选择代工厂加工，自己无法完全掌控生产过程，可能会出现一些意想不到的问题。

2. 难以保护商业机密：选择代工厂加工，需要与代工厂共享自己的商业机密，存在泄露的风险。

3. 品质问题：如果选择的代工厂无法保证产品质量，可能会导致质量问题，影响产品形象和销售。

综上所述，选择代工厂加工燕窝需要综合考虑自己的情况和需求，权衡优缺点，才能做出最好的决策。如果选择代工厂加工，需要选择有良好信誉和高品质的代工厂，并与代工厂建立良好的合作关系，以确保产品质量和生产效率。